Как изменятся правила по НДС в 2025–2026 годах

03.11.2025

С 2025 года вводятся новые правила по налогу на добавленную стоимость (НДС), касающиеся регистрации, ставок, оформления электронных счетов-фактур и контроля со стороны налоговых органов.

Постановка на учет по НДС

Порог обязательной регистрации по НДС установлен на уровне 10 000 МРП (около 40 млн тенге). Постановка может быть:

• добровольной — по желанию налогоплательщика;
• обязательной — при превышении установленного порога;
• условной — в отдельных случаях, предусмотренных законом.

Если организация или ИП превысили порог, они обязаны подать заявление в течение пяти рабочих дней с момента превышения. При заключении крупной сделки — заявление подается до ее совершения.

После регистрации руководитель или бухгалтер должны пройти ознакомление с системой электронных счетов-фактур (ЭСФ) и порядком их выписки.

Штрафы за нарушения:

• за несвоевременную постановку — 50 МРП;
• за деятельность без регистрации при превышении порога — 15% от оборота за этот период.

Президент поручил рассмотреть вопрос освобождения малого бизнеса от штрафов за просрочку регистрации, но пока такие изменения не приняты.

Снятие с учета по НДС

Снятие возможно в случаях:

• перехода на специальный налоговый режим, не предусматривающий НДС;
• прекращения деятельности или ликвидации компании;
• добровольное снятие с учета отменено.

Ставки НДС

С 2025 года основная ставка НДС составляет 16%. Пониженные ставки вводятся поэтапно:

• с 1 января 2026 года — 5% для лекарственных средств, медицинских изделий и ряда медуслуг;
• с 1 января 2027 года — 10% для отечественных печатных изданий.

Освобожденные обороты

От НДС освобождаются:

• реализация лекарств и медицинских услуг в рамках госпрограмм (ГОБМП, ОСМС);
• книги и учебные издания отечественного производства;
• археологические работы;
• реализация жилья, строительство которого начато или завершено до 1 января 2026 года;
• финансовые операции, указанные в статье 477 Налогового кодекса.

Электронные счета-фактуры (ЭСФ)

Для ЭСФ установлены новые правила подтверждения:

• если покупатель плательщик НДС, он обязан подтвердить или отклонить дополнительный/исправленный ЭСФ в течение 10 дней;
• если неплательщик НДС, то при отсутствии ответа ЭСФ считается принятым;
• при бумажных ЭСФ допускается подтверждение подписью и печатью получателя или уведомлением о получении.

Зачет НДС при работе с нерезидентами и в рамках ЕАЭС

При покупке услуг у нерезидента налог можно принять в зачет, если:

• НДС уплачен в бюджет;
• имеется электронный счет-фактура.

Для импорта из стран ЕАЭС зачет производится в налоговом периоде, следующем за месяцем уплаты НДС (но не ранее 20 числа следующего месяца).

Отложенный НДС

С 2026 года налог по ЭСФ будет приниматься в зачет по дате оборота, а не по дате выписки счета-фактуры. Это упростит отражение НДС в учете и уменьшит количество корректировок.

Авансирование и автоматизированный контроль НДС

Для некоторых категорий налогоплательщиков (новых, перерегистрированных, с малым числом работников) вводится контрольный налоговый счет. С него будут списываться суммы НДС при выписке ЭСФ. Если средств недостаточно, счет-фактура не получит регистрационный номер, и документ будет считаться не выписанным.

Пополнить счет можно своими средствами, а неиспользованные деньги вернуть на расчетный счет.

Сопоставительный контроль

Налоговые органы будут сверять данные ЭСФ с отчетностью, информацией банков и госорганов, чтобы подтвердить реальность сделок. Если выявлены сомнения, налогоплательщик получит уведомление. Он может:

• согласиться и отозвать счета-фактуры;
• не согласиться и предоставить пояснения с документами.

Если пояснения не убедительны, налоговики могут заблокировать доступ к системе ЭСФ. Сведения о таких налогоплательщиках будут публиковаться на сайте уполномоченного органа.

Итог: В 2025–2026 годах система НДС в Казахстане претерпевает масштабные изменения — вводится более гибкий порядок учета, электронный контроль и автоматизация налоговых процессов. Это должно повысить прозрачность бизнеса и сократить количество спорных ситуаций с налоговыми органами.